Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms