Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH7

Clstn3, Calsyntenin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3Q99JH7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn3Q99JH7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clstn3Q99JH7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clstn3Q99JH7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clstn3Q99JH7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clstn3Q99JH7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clstn3Q99JH7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clstn3Q99JH7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clstn3Q99JH7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clstn3Q99JH7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.5 ms