Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PdgfdQ925I7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PdgfdQ925I7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PdgfdQ925I7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PdgfdQ925I7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PdgfdQ925I7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PdgfdQ925I7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PdgfdQ925I7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PdgfdQ925I7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PdgfdQ925I7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PdgfdQ925I7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PdgfdQ925I7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PdgfdQ925I7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PdgfdQ925I7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PdgfdQ925I7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PdgfdQ925I7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PdgfdQ925I7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PdgfdQ925I7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PdgfdQ925I7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PdgfdQ925I7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PdgfdQ925I7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PdgfdQ925I7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PdgfdQ925I7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PdgfdQ925I7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PdgfdQ925I7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PdgfdQ925I7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PdgfdQ925I7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PdgfdQ925I7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PdgfdQ925I7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PdgfdQ925I7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PdgfdQ925I7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PdgfdQ925I7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PdgfdQ925I7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PdgfdQ925I7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PdgfdQ925I7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PdgfdQ925I7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PdgfdQ925I7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PdgfdQ925I7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PdgfdQ925I7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PdgfdQ925I7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PdgfdQ925I7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PdgfdQ925I7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PdgfdQ925I7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PdgfdQ925I7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PdgfdQ925I7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PdgfdQ925I7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PdgfdQ925I7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PdgfdQ925I7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PdgfdQ925I7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PdgfdQ925I7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PdgfdQ925I7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PdgfdQ925I7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PdgfdQ925I7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms