Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csmd1Q923L3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms