Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Traf7Q922B6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms