Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sf3b3Q921M3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sf3b3Q921M3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sf3b3Q921M3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Sf3b3Q921M3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sf3b3Q921M3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sf3b3Q921M3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sf3b3Q921M3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sf3b3Q921M3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Sf3b3Q921M3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sf3b3Q921M3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Sf3b3Q921M3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sf3b3Q921M3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sf3b3Q921M3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sf3b3Q921M3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Sf3b3Q921M3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sf3b3Q921M3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Sf3b3Q921M3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sf3b3Q921M3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sf3b3Q921M3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sf3b3Q921M3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sf3b3Q921M3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sf3b3Q921M3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sf3b3Q921M3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sf3b3Q921M3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sf3b3Q921M3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sf3b3Q921M3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sf3b3Q921M3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sf3b3Q921M3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sf3b3Q921M3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Sf3b3Q921M3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sf3b3Q921M3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sf3b3Q921M3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sf3b3Q921M3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sf3b3Q921M3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sf3b3Q921M3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sf3b3Q921M3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sf3b3Q921M3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms