Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Odf3Q920N1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf3Q920N1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms