Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smarca5Q91ZW3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smarca5Q91ZW3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smarca5Q91ZW3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smarca5Q91ZW3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarca5Q91ZW3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarca5Q91ZW3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarca5Q91ZW3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarca5Q91ZW3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarca5Q91ZW3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarca5Q91ZW3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca5Q91ZW3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca5Q91ZW3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca5Q91ZW3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca5Q91ZW3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca5Q91ZW3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca5Q91ZW3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca5Q91ZW3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca5Q91ZW3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarca5Q91ZW3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarca5Q91ZW3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarca5Q91ZW3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarca5Q91ZW3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca5Q91ZW3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca5Q91ZW3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca5Q91ZW3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca5Q91ZW3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca5Q91ZW3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca5Q91ZW3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca5Q91ZW3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca5Q91ZW3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca5Q91ZW3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarca5Q91ZW3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarca5Q91ZW3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarca5Q91ZW3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarca5Q91ZW3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarca5Q91ZW3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarca5Q91ZW3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarca5Q91ZW3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarca5Q91ZW3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarca5Q91ZW3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarca5Q91ZW3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarca5Q91ZW3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarca5Q91ZW3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarca5Q91ZW3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarca5Q91ZW3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarca5Q91ZW3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarca5Q91ZW3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarca5Q91ZW3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarca5Q91ZW3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarca5Q91ZW3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarca5Q91ZW3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarca5Q91ZW3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca5Q91ZW3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca5Q91ZW3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca5Q91ZW3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca5Q91ZW3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarca5Q91ZW3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarca5Q91ZW3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarca5Q91ZW3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarca5Q91ZW3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarca5Q91ZW3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarca5Q91ZW3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarca5Q91ZW3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarca5Q91ZW3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarca5Q91ZW3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarca5Q91ZW3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms