Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR1

Rab4b, Ras-related protein Rab-4B, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4bQ91ZR1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab4bQ91ZR1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms