Protein–RNA interactions for Protein: Q91Z38

Ttc1, Tetratricopeptide repeat protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc1Q91Z38 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc1Q91Z38 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms