Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rrp1bQ91YK2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms