Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y11

Pcdha9, Protocadherin alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha9Q91Y11 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdha9Q91Y11 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcdha9Q91Y11 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcdha9Q91Y11 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcdha9Q91Y11 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcdha9Q91Y11 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcdha9Q91Y11 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcdha9Q91Y11 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcdha9Q91Y11 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcdha9Q91Y11 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcdha9Q91Y11 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcdha9Q91Y11 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdha9Q91Y11 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdha9Q91Y11 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdha9Q91Y11 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdha9Q91Y11 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms