Protein–RNA interactions for Protein: Q91WS2

Nlrp6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp6Q91WS2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nlrp6Q91WS2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Nlrp6Q91WS2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nlrp6Q91WS2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nlrp6Q91WS2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Nlrp6Q91WS2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nlrp6Q91WS2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nlrp6Q91WS2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nlrp6Q91WS2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nlrp6Q91WS2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nlrp6Q91WS2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nlrp6Q91WS2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nlrp6Q91WS2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nlrp6Q91WS2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nlrp6Q91WS2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nlrp6Q91WS2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nlrp6Q91WS2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nlrp6Q91WS2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Nlrp6Q91WS2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nlrp6Q91WS2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nlrp6Q91WS2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nlrp6Q91WS2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nlrp6Q91WS2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms