Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csde1Q91W50 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csde1Q91W50 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms