Protein–RNA interactions for Protein: Q91VK4

Itm2c, Integral membrane protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2cQ91VK4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itm2cQ91VK4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itm2cQ91VK4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Itm2cQ91VK4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itm2cQ91VK4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itm2cQ91VK4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itm2cQ91VK4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itm2cQ91VK4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itm2cQ91VK4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itm2cQ91VK4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itm2cQ91VK4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itm2cQ91VK4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itm2cQ91VK4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itm2cQ91VK4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itm2cQ91VK4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itm2cQ91VK4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itm2cQ91VK4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itm2cQ91VK4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itm2cQ91VK4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itm2cQ91VK4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itm2cQ91VK4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itm2cQ91VK4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itm2cQ91VK4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Itm2cQ91VK4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Itm2cQ91VK4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itm2cQ91VK4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itm2cQ91VK4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Itm2cQ91VK4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itm2cQ91VK4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itm2cQ91VK4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itm2cQ91VK4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Itm2cQ91VK4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Itm2cQ91VK4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itm2cQ91VK4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Itm2cQ91VK4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itm2cQ91VK4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itm2cQ91VK4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itm2cQ91VK4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itm2cQ91VK4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itm2cQ91VK4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itm2cQ91VK4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Itm2cQ91VK4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itm2cQ91VK4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itm2cQ91VK4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itm2cQ91VK4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itm2cQ91VK4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itm2cQ91VK4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itm2cQ91VK4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itm2cQ91VK4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itm2cQ91VK4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itm2cQ91VK4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Itm2cQ91VK4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itm2cQ91VK4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itm2cQ91VK4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Itm2cQ91VK4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Itm2cQ91VK4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itm2cQ91VK4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms