Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hps3Q91VB4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms