Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ApofQ91V80 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ApofQ91V80 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ApofQ91V80 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ApofQ91V80 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ApofQ91V80 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ApofQ91V80 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ApofQ91V80 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ApofQ91V80 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ApofQ91V80 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ApofQ91V80 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ApofQ91V80 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ApofQ91V80 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ApofQ91V80 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ApofQ91V80 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ApofQ91V80 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ApofQ91V80 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ApofQ91V80 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ApofQ91V80 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ApofQ91V80 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ApofQ91V80 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ApofQ91V80 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ApofQ91V80 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ApofQ91V80 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ApofQ91V80 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ApofQ91V80 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ApofQ91V80 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ApofQ91V80 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ApofQ91V80 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ApofQ91V80 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ApofQ91V80 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ApofQ91V80 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ApofQ91V80 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ApofQ91V80 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ApofQ91V80 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ApofQ91V80 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ApofQ91V80 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ApofQ91V80 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ApofQ91V80 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ApofQ91V80 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ApofQ91V80 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ApofQ91V80 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ApofQ91V80 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ApofQ91V80 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ApofQ91V80 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ApofQ91V80 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms