Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmcd1Q8VEE1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmcd1Q8VEE1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lmcd1Q8VEE1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms