Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS3

Cbx7, Chromobox protein homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx7Q8VDS3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx7Q8VDS3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms