Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1Q8VDF2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uhrf1Q8VDF2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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