Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Fyco1Q8VDC1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Fyco1Q8VDC1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Fyco1Q8VDC1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Fyco1Q8VDC1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Fyco1Q8VDC1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Fyco1Q8VDC1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Fyco1Q8VDC1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Fyco1Q8VDC1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Fyco1Q8VDC1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Fyco1Q8VDC1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Fyco1Q8VDC1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Fyco1Q8VDC1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Fyco1Q8VDC1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Fyco1Q8VDC1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Fyco1Q8VDC1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Fyco1Q8VDC1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Fyco1Q8VDC1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Fyco1Q8VDC1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Fyco1Q8VDC1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Fyco1Q8VDC1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Fyco1Q8VDC1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Fyco1Q8VDC1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Fyco1Q8VDC1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Fyco1Q8VDC1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Fyco1Q8VDC1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Fyco1Q8VDC1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Fyco1Q8VDC1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Fyco1Q8VDC1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Fyco1Q8VDC1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Fyco1Q8VDC1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Fyco1Q8VDC1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Fyco1Q8VDC1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Fyco1Q8VDC1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Fyco1Q8VDC1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Fyco1Q8VDC1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Fyco1Q8VDC1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Fyco1Q8VDC1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Fyco1Q8VDC1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Fyco1Q8VDC1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Fyco1Q8VDC1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Fyco1Q8VDC1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Fyco1Q8VDC1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Fyco1Q8VDC1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Fyco1Q8VDC1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Fyco1Q8VDC1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Fyco1Q8VDC1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Fyco1Q8VDC1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Fyco1Q8VDC1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Fyco1Q8VDC1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Fyco1Q8VDC1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Fyco1Q8VDC1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Fyco1Q8VDC1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Fyco1Q8VDC1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Fyco1Q8VDC1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Fyco1Q8VDC1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Fyco1Q8VDC1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Fyco1Q8VDC1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Fyco1Q8VDC1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Fyco1Q8VDC1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Fyco1Q8VDC1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Fyco1Q8VDC1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Fyco1Q8VDC1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Fyco1Q8VDC1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Fyco1Q8VDC1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Fyco1Q8VDC1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Fyco1Q8VDC1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Fyco1Q8VDC1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Fyco1Q8VDC1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Fyco1Q8VDC1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Fyco1Q8VDC1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Fyco1Q8VDC1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Fyco1Q8VDC1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Fyco1Q8VDC1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Fyco1Q8VDC1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Fyco1Q8VDC1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Fyco1Q8VDC1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Fyco1Q8VDC1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Fyco1Q8VDC1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Fyco1Q8VDC1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Fyco1Q8VDC1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Fyco1Q8VDC1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Fyco1Q8VDC1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
Fyco1Q8VDC1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Fyco1Q8VDC1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Fyco1Q8VDC1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Fyco1Q8VDC1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Fyco1Q8VDC1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Fyco1Q8VDC1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Fyco1Q8VDC1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Fyco1Q8VDC1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Fyco1Q8VDC1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Fyco1Q8VDC1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Fyco1Q8VDC1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Fyco1Q8VDC1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Fyco1Q8VDC1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Fyco1Q8VDC1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Fyco1Q8VDC1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Fyco1Q8VDC1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Fyco1Q8VDC1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms