Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc8Q8VD72 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ttc8Q8VD72 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc8Q8VD72 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc8Q8VD72 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc8Q8VD72 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc8Q8VD72 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc8Q8VD72 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc8Q8VD72 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc8Q8VD72 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc8Q8VD72 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc8Q8VD72 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc8Q8VD72 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc8Q8VD72 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc8Q8VD72 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc8Q8VD72 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc8Q8VD72 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms