Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCV1

Abhd17c, Protein ABHD17C, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abhd17cQ8VCV1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abhd17cQ8VCV1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abhd17cQ8VCV1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abhd17cQ8VCV1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Abhd17cQ8VCV1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abhd17cQ8VCV1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abhd17cQ8VCV1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abhd17cQ8VCV1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abhd17cQ8VCV1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abhd17cQ8VCV1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abhd17cQ8VCV1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Abhd17cQ8VCV1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abhd17cQ8VCV1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abhd17cQ8VCV1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abhd17cQ8VCV1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Abhd17cQ8VCV1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Abhd17cQ8VCV1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Abhd17cQ8VCV1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Abhd17cQ8VCV1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abhd17cQ8VCV1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Abhd17cQ8VCV1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Abhd17cQ8VCV1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abhd17cQ8VCV1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abhd17cQ8VCV1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abhd17cQ8VCV1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abhd17cQ8VCV1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abhd17cQ8VCV1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abhd17cQ8VCV1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abhd17cQ8VCV1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abhd17cQ8VCV1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abhd17cQ8VCV1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abhd17cQ8VCV1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abhd17cQ8VCV1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.8 ms