Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubxn4Q8VCH8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms