Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med17Q8VCD5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med17Q8VCD5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med17Q8VCD5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med17Q8VCD5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Med17Q8VCD5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Med17Q8VCD5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med17Q8VCD5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med17Q8VCD5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Med17Q8VCD5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Med17Q8VCD5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Med17Q8VCD5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Med17Q8VCD5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Med17Q8VCD5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med17Q8VCD5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms