Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W2

0610009B22Rik, MCG6979, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
0610009B22RikQ8R3W2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
0610009B22RikQ8R3W2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
0610009B22RikQ8R3W2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
0610009B22RikQ8R3W2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
0610009B22RikQ8R3W2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
0610009B22RikQ8R3W2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
0610009B22RikQ8R3W2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
0610009B22RikQ8R3W2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
0610009B22RikQ8R3W2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
0610009B22RikQ8R3W2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
0610009B22RikQ8R3W2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
0610009B22RikQ8R3W2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
0610009B22RikQ8R3W2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
0610009B22RikQ8R3W2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
0610009B22RikQ8R3W2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
0610009B22RikQ8R3W2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
0610009B22RikQ8R3W2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
0610009B22RikQ8R3W2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
0610009B22RikQ8R3W2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
0610009B22RikQ8R3W2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
0610009B22RikQ8R3W2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms