Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc58Q8R3Q6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms