Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim29Q8R2Q0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim29Q8R2Q0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim29Q8R2Q0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim29Q8R2Q0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim29Q8R2Q0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim29Q8R2Q0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim29Q8R2Q0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim29Q8R2Q0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim29Q8R2Q0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim29Q8R2Q0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim29Q8R2Q0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim29Q8R2Q0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim29Q8R2Q0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim29Q8R2Q0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim29Q8R2Q0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim29Q8R2Q0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim29Q8R2Q0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim29Q8R2Q0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim29Q8R2Q0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim29Q8R2Q0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim29Q8R2Q0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim29Q8R2Q0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim29Q8R2Q0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim29Q8R2Q0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim29Q8R2Q0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim29Q8R2Q0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim29Q8R2Q0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim29Q8R2Q0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim29Q8R2Q0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim29Q8R2Q0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim29Q8R2Q0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim29Q8R2Q0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim29Q8R2Q0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim29Q8R2Q0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim29Q8R2Q0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim29Q8R2Q0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim29Q8R2Q0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim29Q8R2Q0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim29Q8R2Q0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim29Q8R2Q0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim29Q8R2Q0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim29Q8R2Q0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim29Q8R2Q0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim29Q8R2Q0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim29Q8R2Q0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim29Q8R2Q0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim29Q8R2Q0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim29Q8R2Q0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim29Q8R2Q0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim29Q8R2Q0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim29Q8R2Q0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim29Q8R2Q0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim29Q8R2Q0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim29Q8R2Q0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim29Q8R2Q0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim29Q8R2Q0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim29Q8R2Q0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim29Q8R2Q0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim29Q8R2Q0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim29Q8R2Q0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim29Q8R2Q0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim29Q8R2Q0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim29Q8R2Q0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim29Q8R2Q0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim29Q8R2Q0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim29Q8R2Q0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim29Q8R2Q0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms