Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z5

Sf3a1, Splicing factor 3A subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a1Q8K4Z5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sf3a1Q8K4Z5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sf3a1Q8K4Z5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sf3a1Q8K4Z5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sf3a1Q8K4Z5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sf3a1Q8K4Z5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sf3a1Q8K4Z5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sf3a1Q8K4Z5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sf3a1Q8K4Z5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sf3a1Q8K4Z5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sf3a1Q8K4Z5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sf3a1Q8K4Z5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sf3a1Q8K4Z5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sf3a1Q8K4Z5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sf3a1Q8K4Z5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sf3a1Q8K4Z5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sf3a1Q8K4Z5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sf3a1Q8K4Z5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sf3a1Q8K4Z5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Sf3a1Q8K4Z5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sf3a1Q8K4Z5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sf3a1Q8K4Z5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sf3a1Q8K4Z5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sf3a1Q8K4Z5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sf3a1Q8K4Z5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sf3a1Q8K4Z5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sf3a1Q8K4Z5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sf3a1Q8K4Z5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sf3a1Q8K4Z5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sf3a1Q8K4Z5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sf3a1Q8K4Z5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sf3a1Q8K4Z5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sf3a1Q8K4Z5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sf3a1Q8K4Z5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sf3a1Q8K4Z5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sf3a1Q8K4Z5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sf3a1Q8K4Z5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sf3a1Q8K4Z5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sf3a1Q8K4Z5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sf3a1Q8K4Z5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sf3a1Q8K4Z5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sf3a1Q8K4Z5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sf3a1Q8K4Z5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sf3a1Q8K4Z5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Sf3a1Q8K4Z5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sf3a1Q8K4Z5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sf3a1Q8K4Z5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sf3a1Q8K4Z5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sf3a1Q8K4Z5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sf3a1Q8K4Z5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sf3a1Q8K4Z5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sf3a1Q8K4Z5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.1 ms