Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Q3

Foxn4, Forkhead box protein N4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn4Q8K3Q3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms