Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
OptnQ8K3K8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
OptnQ8K3K8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
OptnQ8K3K8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
OptnQ8K3K8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
OptnQ8K3K8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
OptnQ8K3K8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
OptnQ8K3K8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
OptnQ8K3K8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
OptnQ8K3K8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
OptnQ8K3K8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
OptnQ8K3K8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
OptnQ8K3K8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
OptnQ8K3K8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
OptnQ8K3K8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
OptnQ8K3K8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
OptnQ8K3K8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
OptnQ8K3K8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
OptnQ8K3K8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
OptnQ8K3K8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
OptnQ8K3K8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
OptnQ8K3K8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
OptnQ8K3K8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
OptnQ8K3K8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
OptnQ8K3K8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
OptnQ8K3K8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
OptnQ8K3K8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
OptnQ8K3K8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
OptnQ8K3K8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
OptnQ8K3K8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
OptnQ8K3K8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
OptnQ8K3K8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
OptnQ8K3K8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
OptnQ8K3K8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
OptnQ8K3K8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
OptnQ8K3K8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
OptnQ8K3K8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
OptnQ8K3K8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
OptnQ8K3K8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
OptnQ8K3K8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
OptnQ8K3K8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
OptnQ8K3K8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
OptnQ8K3K8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
OptnQ8K3K8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
OptnQ8K3K8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
OptnQ8K3K8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
OptnQ8K3K8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
OptnQ8K3K8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
OptnQ8K3K8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
OptnQ8K3K8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
OptnQ8K3K8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
OptnQ8K3K8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
OptnQ8K3K8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
OptnQ8K3K8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
OptnQ8K3K8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms