Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrtm1Q8K377 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms