Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prpf39Q8K2Z2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf39Q8K2Z2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf39Q8K2Z2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf39Q8K2Z2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf39Q8K2Z2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf39Q8K2Z2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf39Q8K2Z2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf39Q8K2Z2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf39Q8K2Z2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf39Q8K2Z2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf39Q8K2Z2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf39Q8K2Z2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf39Q8K2Z2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf39Q8K2Z2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf39Q8K2Z2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf39Q8K2Z2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf39Q8K2Z2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf39Q8K2Z2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf39Q8K2Z2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf39Q8K2Z2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf39Q8K2Z2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf39Q8K2Z2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf39Q8K2Z2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf39Q8K2Z2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf39Q8K2Z2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf39Q8K2Z2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf39Q8K2Z2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf39Q8K2Z2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf39Q8K2Z2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf39Q8K2Z2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf39Q8K2Z2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms