Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccm2Q8K2Y9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccm2Q8K2Y9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccm2Q8K2Y9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccm2Q8K2Y9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccm2Q8K2Y9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccm2Q8K2Y9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccm2Q8K2Y9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccm2Q8K2Y9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccm2Q8K2Y9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccm2Q8K2Y9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccm2Q8K2Y9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccm2Q8K2Y9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccm2Q8K2Y9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccm2Q8K2Y9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccm2Q8K2Y9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccm2Q8K2Y9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccm2Q8K2Y9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccm2Q8K2Y9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccm2Q8K2Y9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccm2Q8K2Y9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccm2Q8K2Y9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccm2Q8K2Y9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccm2Q8K2Y9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccm2Q8K2Y9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccm2Q8K2Y9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccm2Q8K2Y9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms