Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Paf1Q8K2T8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Paf1Q8K2T8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Paf1Q8K2T8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Paf1Q8K2T8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Paf1Q8K2T8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Paf1Q8K2T8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Paf1Q8K2T8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Paf1Q8K2T8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Paf1Q8K2T8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Paf1Q8K2T8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Paf1Q8K2T8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Paf1Q8K2T8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Paf1Q8K2T8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Paf1Q8K2T8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Paf1Q8K2T8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Paf1Q8K2T8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Paf1Q8K2T8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Paf1Q8K2T8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Paf1Q8K2T8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Paf1Q8K2T8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Paf1Q8K2T8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Paf1Q8K2T8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Paf1Q8K2T8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Paf1Q8K2T8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Paf1Q8K2T8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Paf1Q8K2T8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Paf1Q8K2T8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Paf1Q8K2T8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Paf1Q8K2T8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Paf1Q8K2T8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Paf1Q8K2T8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Paf1Q8K2T8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Paf1Q8K2T8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Paf1Q8K2T8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Paf1Q8K2T8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Paf1Q8K2T8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Paf1Q8K2T8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Paf1Q8K2T8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms