Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Otud6bQ8K2H2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms