Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Depp1Q8K2F3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms