Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Neil3Q8K203 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Neil3Q8K203 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Neil3Q8K203 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Neil3Q8K203 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Neil3Q8K203 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Neil3Q8K203 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Neil3Q8K203 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Neil3Q8K203 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Neil3Q8K203 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Neil3Q8K203 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Neil3Q8K203 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Neil3Q8K203 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Neil3Q8K203 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Neil3Q8K203 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Neil3Q8K203 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms