Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1C9

Lrrc41, Leucine-rich repeat-containing protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc41Q8K1C9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc41Q8K1C9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc41Q8K1C9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc41Q8K1C9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc41Q8K1C9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc41Q8K1C9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc41Q8K1C9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc41Q8K1C9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc41Q8K1C9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc41Q8K1C9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc41Q8K1C9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc41Q8K1C9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc41Q8K1C9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc41Q8K1C9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc41Q8K1C9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc41Q8K1C9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc41Q8K1C9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc41Q8K1C9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc41Q8K1C9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc41Q8K1C9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc41Q8K1C9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc41Q8K1C9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc41Q8K1C9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc41Q8K1C9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc41Q8K1C9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc41Q8K1C9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc41Q8K1C9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc41Q8K1C9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc41Q8K1C9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc41Q8K1C9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc41Q8K1C9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc41Q8K1C9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc41Q8K1C9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc41Q8K1C9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc41Q8K1C9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc41Q8K1C9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc41Q8K1C9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc41Q8K1C9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc41Q8K1C9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc41Q8K1C9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc41Q8K1C9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc41Q8K1C9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc41Q8K1C9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc41Q8K1C9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc41Q8K1C9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc41Q8K1C9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc41Q8K1C9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc41Q8K1C9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc41Q8K1C9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc41Q8K1C9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc41Q8K1C9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc41Q8K1C9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103 ms