Protein–RNA interactions for Protein: Q8K174

Tmem60, Transmembrane protein 60, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem60Q8K174 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmem60Q8K174 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem60Q8K174 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem60Q8K174 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem60Q8K174 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem60Q8K174 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem60Q8K174 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem60Q8K174 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem60Q8K174 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem60Q8K174 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem60Q8K174 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem60Q8K174 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem60Q8K174 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem60Q8K174 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem60Q8K174 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem60Q8K174 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem60Q8K174 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem60Q8K174 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem60Q8K174 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem60Q8K174 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem60Q8K174 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem60Q8K174 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem60Q8K174 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem60Q8K174 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem60Q8K174 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem60Q8K174 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem60Q8K174 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem60Q8K174 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem60Q8K174 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem60Q8K174 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem60Q8K174 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem60Q8K174 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem60Q8K174 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem60Q8K174 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem60Q8K174 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmem60Q8K174 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem60Q8K174 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem60Q8K174 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem60Q8K174 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem60Q8K174 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem60Q8K174 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem60Q8K174 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem60Q8K174 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem60Q8K174 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem60Q8K174 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem60Q8K174 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem60Q8K174 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem60Q8K174 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem60Q8K174 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem60Q8K174 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem60Q8K174 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem60Q8K174 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem60Q8K174 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem60Q8K174 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem60Q8K174 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem60Q8K174 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem60Q8K174 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem60Q8K174 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem60Q8K174 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem60Q8K174 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem60Q8K174 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms