Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FgbQ8K0E8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FgbQ8K0E8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms