Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Trip10Q8CJ53 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trip10Q8CJ53 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Trip10Q8CJ53 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trip10Q8CJ53 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trip10Q8CJ53 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trip10Q8CJ53 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Trip10Q8CJ53 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trip10Q8CJ53 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trip10Q8CJ53 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trip10Q8CJ53 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trip10Q8CJ53 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trip10Q8CJ53 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trip10Q8CJ53 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trip10Q8CJ53 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trip10Q8CJ53 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trip10Q8CJ53 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trip10Q8CJ53 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trip10Q8CJ53 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip10Q8CJ53 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip10Q8CJ53 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip10Q8CJ53 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip10Q8CJ53 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip10Q8CJ53 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip10Q8CJ53 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip10Q8CJ53 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip10Q8CJ53 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip10Q8CJ53 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip10Q8CJ53 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip10Q8CJ53 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip10Q8CJ53 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip10Q8CJ53 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip10Q8CJ53 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip10Q8CJ53 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip10Q8CJ53 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip10Q8CJ53 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip10Q8CJ53 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip10Q8CJ53 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trip10Q8CJ53 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms