Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LgsnQ8CIX8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LgsnQ8CIX8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LgsnQ8CIX8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LgsnQ8CIX8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LgsnQ8CIX8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LgsnQ8CIX8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LgsnQ8CIX8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LgsnQ8CIX8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LgsnQ8CIX8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LgsnQ8CIX8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LgsnQ8CIX8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LgsnQ8CIX8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LgsnQ8CIX8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LgsnQ8CIX8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LgsnQ8CIX8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LgsnQ8CIX8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms