Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NgefQ8CHT1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NgefQ8CHT1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NgefQ8CHT1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NgefQ8CHT1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NgefQ8CHT1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NgefQ8CHT1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NgefQ8CHT1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NgefQ8CHT1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NgefQ8CHT1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NgefQ8CHT1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NgefQ8CHT1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NgefQ8CHT1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NgefQ8CHT1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NgefQ8CHT1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NgefQ8CHT1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NgefQ8CHT1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NgefQ8CHT1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NgefQ8CHT1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NgefQ8CHT1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NgefQ8CHT1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NgefQ8CHT1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NgefQ8CHT1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NgefQ8CHT1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NgefQ8CHT1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NgefQ8CHT1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NgefQ8CHT1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NgefQ8CHT1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NgefQ8CHT1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NgefQ8CHT1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NgefQ8CHT1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NgefQ8CHT1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NgefQ8CHT1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NgefQ8CHT1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NgefQ8CHT1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NgefQ8CHT1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NgefQ8CHT1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NgefQ8CHT1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NgefQ8CHT1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NgefQ8CHT1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NgefQ8CHT1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NgefQ8CHT1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NgefQ8CHT1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NgefQ8CHT1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NgefQ8CHT1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NgefQ8CHT1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NgefQ8CHT1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NgefQ8CHT1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NgefQ8CHT1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NgefQ8CHT1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NgefQ8CHT1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NgefQ8CHT1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NgefQ8CHT1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NgefQ8CHT1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NgefQ8CHT1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NgefQ8CHT1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NgefQ8CHT1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NgefQ8CHT1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NgefQ8CHT1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NgefQ8CHT1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms