Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Ercc8Q8CFD5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Ercc8Q8CFD5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Ercc8Q8CFD5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Ercc8Q8CFD5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Ercc8Q8CFD5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Ercc8Q8CFD5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ercc8Q8CFD5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Ercc8Q8CFD5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Ercc8Q8CFD5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc8Q8CFD5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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