Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nup88Q8CEC0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms