Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl11Q8CE33 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl11Q8CE33 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl11Q8CE33 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl11Q8CE33 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl11Q8CE33 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl11Q8CE33 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl11Q8CE33 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl11Q8CE33 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl11Q8CE33 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl11Q8CE33 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl11Q8CE33 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl11Q8CE33 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl11Q8CE33 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl11Q8CE33 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl11Q8CE33 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl11Q8CE33 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl11Q8CE33 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl11Q8CE33 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhl11Q8CE33 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhl11Q8CE33 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhl11Q8CE33 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhl11Q8CE33 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhl11Q8CE33 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhl11Q8CE33 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhl11Q8CE33 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl11Q8CE33 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl11Q8CE33 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl11Q8CE33 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl11Q8CE33 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl11Q8CE33 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl11Q8CE33 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl11Q8CE33 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl11Q8CE33 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl11Q8CE33 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl11Q8CE33 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl11Q8CE33 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl11Q8CE33 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl11Q8CE33 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms