Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDC0

Serpinb13, Serpin B13, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinb13Q8CDC0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Serpinb13Q8CDC0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Serpinb13Q8CDC0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Serpinb13Q8CDC0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Serpinb13Q8CDC0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Serpinb13Q8CDC0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Serpinb13Q8CDC0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Serpinb13Q8CDC0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Serpinb13Q8CDC0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms