Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms