Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCF0

Prpf31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf31Q8CCF0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prpf31Q8CCF0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf31Q8CCF0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms